山形城跡に建つ本館は、山形の成りたちから今日までを地学・植物・動物・考古・歴史・民俗部門に分け展示する博物館で、スキー場で名高い蔵王山にも近い。
収蔵資料約=二万四〇〇〇点の中には、雪国独特の民具や農耕用具、農家の囲炉裏端の再現もあり、農山村の生活を肌で感じることができる。
また、柴田コレクションのこけし、池田コレクションの洋蘭図譜、おし葉標本、野鳥標本、きのこ図譜などのコレクションがあり全国有数の情報量を誇っている。
付属施設には国指定の重要文化財「旧山形師範学校本館」の建物に開館した教育資料館、白鷹山腹に位置する県指定の天然記念物琵琶沼を中心にした自然学習園があり、このあたりは県民の森として親しまれている。昭和四十六年の開館。
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